有限合伙制创业投资企业采取股权投资方式投资于未上市的中小高新技术企业满2年（24个月）的，其法人合伙人可按照对未上市中小高新技术企业投资额的70%抵扣该法人合伙人从该有限合伙制创业投资企业分得的应纳税所得额，当年不足抵扣的，可以在以后纳税年度结转抵扣。

存在股权（股票）激励（含境内企业以境外企业股权为标的对员工进行的股权激励）、职务科技成果转化现金奖励等情况的单位，应当按照相关规定进行报告、备案。同时，纳税人在一个纳税年度内从同一单位多次取得股权激励的，由该单位合并计算扣缴税款。纳税人在一个纳税年度内从不同单位取得股权激励的，可将之前单位取得的股权激励有关信息提供给现单位并由其合并计算扣缴税款，也可在次年3月1日至6月30日自行向税务机关办理合并申报。

自2019年9月1日（含）起，个人转让新三板挂牌公司原始股的个人所得税，以股票托管的证券机构为扣缴义务人，由股票托管的证券机构所在地主管税务机关负责征收管理。具体征收管理办法参照《财政部 国家税务总局 证监会关于个人转让上市公司限售股所得征收个人所得税有关问题的通知》（财税〔2009〕167号）和《财政部 国家税务总局 证监会关于个人转让上市公司限售股所得征收个人所得税有关问题的补充通知》（财税〔2010〕70号）有关规定执行。

部分当事人试图通过司法确权程序将代持股权变更至隐名股东名下，主张不构成股权转让。但税务机关可能依据税总2014年第67号公告第三条第四项“股权被司法或行政机关强制过户”属于股权转让行为征税，如诉讼请求直接指向股权归属确认，多数案例未予征税；若仅为给付之诉(如返还利润)，可能不被认可。

2023年新修订《公司法》对股权转让前置规则作出细化升级，明确了书面通知、股东同意、优先购买、章程优先、税务前置等硬性要求。任何一步缺失，都可能导致股权转让行为存在重大瑕疵，甚至直接无效。